Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiitaP79621 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiitaP79621 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CiitaP79621 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CiitaP79621 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CiitaP79621 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CiitaP79621 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CiitaP79621 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiitaP79621 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CiitaP79621 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CiitaP79621 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CiitaP79621 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CiitaP79621 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CiitaP79621 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CiitaP79621 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms