Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprvP70289 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprvP70289 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprvP70289 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprvP70289 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprvP70289 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprvP70289 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprvP70289 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprvP70289 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprvP70289 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprvP70289 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprvP70289 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprvP70289 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 484.8 ms