Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2bP62915 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2bP62915 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gtf2bP62915 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms