Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga11P61622 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga11P61622 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga11P61622 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga11P61622 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga11P61622 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga11P61622 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga11P61622 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga11P61622 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga11P61622 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga11P61622 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms