Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3eP60229 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3eP60229 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3eP60229 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Eif3eP60229 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms