Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nphp4P59240 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp4P59240 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nphp4P59240 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms