Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp3P58854 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp3P58854 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms