Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samsn1P57725 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samsn1P57725 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms