Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp25P57080 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp25P57080 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp25P57080 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp25P57080 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp25P57080 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp25P57080 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp25P57080 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp25P57080 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp25P57080 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp25P57080 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms