Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a1P55014 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a1P55014 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc12a1P55014 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a1P55014 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a1P55014 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms