Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb41P48193 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epb41P48193 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epb41P48193 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epb41P48193 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Epb41P48193 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Epb41P48193 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Epb41P48193 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Epb41P48193 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epb41P48193 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Epb41P48193 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms