Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl13P47963 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms