Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nedd4P46935 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd4P46935 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms