Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms