Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx2-5P42582 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms