Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab20P35295 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab20P35295 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab20P35295 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab20P35295 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab20P35295 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms