Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab21P35282 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab21P35282 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rab21P35282 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab21P35282 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rab21P35282 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab21P35282 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms