Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa2P31245 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms