Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kif3aP28741 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif3aP28741 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif3aP28741 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms