Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bmi1P25916 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bmi1P25916 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms