Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd8P23463 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd8P23463 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd8P23463 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxd8P23463 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd8P23463 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms