Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prim1P20664 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prim1P20664 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prim1P20664 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prim1P20664 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prim1P20664 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prim1P20664 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prim1P20664 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prim1P20664 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prim1P20664 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prim1P20664 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prim1P20664 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prim1P20664 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms