Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxb9P20615 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb9P20615 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms