Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lama1P19137 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lama1P19137 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lama1P19137 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lama1P19137 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lama1P19137 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lama1P19137 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lama1P19137 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms