Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa1P11477 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa1P11477 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa1P11477 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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