Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AfpP02772 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AfpP02772 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AfpP02772 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AfpP02772 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AfpP02772 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AfpP02772 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AfpP02772 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AfpP02772 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AfpP02772 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AfpP02772 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AfpP02772 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AfpP02772 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AfpP02772 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AfpP02772 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AfpP02772 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AfpP02772 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AfpP02772 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AfpP02772 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AfpP02772 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AfpP02772 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AfpP02772 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AfpP02772 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AfpP02772 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AfpP02772 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AfpP02772 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AfpP02772 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AfpP02772 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AfpP02772 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AfpP02772 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AfpP02772 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AfpP02772 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AfpP02772 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AfpP02772 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AfpP02772 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AfpP02772 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AfpP02772 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AfpP02772 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AfpP02772 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AfpP02772 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AfpP02772 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AfpP02772 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AfpP02772 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AfpP02772 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AfpP02772 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AfpP02772 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AfpP02772 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AfpP02772 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AfpP02772 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AfpP02772 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AfpP02772 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AfpP02772 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AfpP02772 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AfpP02772 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AfpP02772 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AfpP02772 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AfpP02772 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AfpP02772 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AfpP02772 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AfpP02772 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AfpP02772 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms