Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01811 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01811 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01811 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01811 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01811 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01811 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01811 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01811 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01811 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01811 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01811 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01811 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01811 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01811 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01811 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01811 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01811 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01811 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01811 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01811 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01811 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01811 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01811 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01811 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01811 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01811 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01811 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01811 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01811 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01811 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01811 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01811 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01811 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01811 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01811 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms