Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01656 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01656 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01656 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01656 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01656 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01656 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01656 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01656 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01656 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01656 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01656 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01656 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01656 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01656 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01656 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P01656 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01656 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01656 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01656 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01656 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01656 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01656 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01656 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01656 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01656 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01656 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01656 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01656 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01656 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01656 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01656 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01656 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01656 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
P01656 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01656 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01656 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01656 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01656 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
P01656 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01656 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01656 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01656 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01656 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01656 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01656 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01656 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01656 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01656 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01656 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01656 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01656 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01656 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01656 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01656 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01656 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01656 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01656 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01656 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P01656 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01656 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01656 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01656 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms