Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ComtO88587 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ComtO88587 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ComtO88587 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ComtO88587 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ComtO88587 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ComtO88587 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ComtO88587 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ComtO88587 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ComtO88587 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ComtO88587 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ComtO88587 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ComtO88587 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ComtO88587 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ComtO88587 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ComtO88587 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ComtO88587 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ComtO88587 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ComtO88587 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ComtO88587 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ComtO88587 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ComtO88587 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ComtO88587 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ComtO88587 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ComtO88587 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ComtO88587 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ComtO88587 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ComtO88587 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ComtO88587 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ComtO88587 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ComtO88587 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ComtO88587 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ComtO88587 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ComtO88587 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ComtO88587 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ComtO88587 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ComtO88587 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ComtO88587 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ComtO88587 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ComtO88587 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ComtO88587 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ComtO88587 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ComtO88587 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ComtO88587 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ComtO88587 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ComtO88587 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ComtO88587 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ComtO88587 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ComtO88587 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ComtO88587 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ComtO88587 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ComtO88587 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ComtO88587 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ComtO88587 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ComtO88587 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ComtO88587 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms