Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sorl1O88307 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sorl1O88307 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sorl1O88307 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms