Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlkO54988 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlkO54988 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlkO54988 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlkO54988 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlkO54988 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlkO54988 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SlkO54988 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlkO54988 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlkO54988 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlkO54988 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SlkO54988 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlkO54988 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlkO54988 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlkO54988 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlkO54988 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlkO54988 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlkO54988 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SlkO54988 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlkO54988 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlkO54988 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlkO54988 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlkO54988 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlkO54988 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlkO54988 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SlkO54988 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlkO54988 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlkO54988 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlkO54988 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlkO54988 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlkO54988 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SlkO54988 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SlkO54988 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SlkO54988 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SlkO54988 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SlkO54988 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SlkO54988 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlkO54988 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlkO54988 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlkO54988 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SlkO54988 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlkO54988 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SlkO54988 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SlkO54988 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SlkO54988 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SlkO54988 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SlkO54988 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SlkO54988 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlkO54988 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlkO54988 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlkO54988 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlkO54988 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlkO54988 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlkO54988 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlkO54988 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlkO54988 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SlkO54988 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlkO54988 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlkO54988 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlkO54988 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SlkO54988 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SlkO54988 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SlkO54988 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlkO54988 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlkO54988 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlkO54988 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlkO54988 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SlkO54988 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlkO54988 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlkO54988 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SlkO54988 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SlkO54988 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SlkO54988 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SlkO54988 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SlkO54988 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SlkO54988 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SlkO54988 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SlkO54988 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlkO54988 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms