Protein–RNA interactions for Protein: O54863

Tssk2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk2O54863 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tssk2O54863 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tssk2O54863 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tssk2O54863 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms