Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffbO54788 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffbO54788 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffbO54788 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffbO54788 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffbO54788 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffbO54788 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffbO54788 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffbO54788 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffbO54788 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DffbO54788 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DffbO54788 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffbO54788 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DffbO54788 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffbO54788 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffbO54788 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffbO54788 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffbO54788 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffbO54788 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffbO54788 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffbO54788 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffbO54788 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffbO54788 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffbO54788 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffbO54788 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffbO54788 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffbO54788 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffbO54788 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffbO54788 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffbO54788 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffbO54788 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffbO54788 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffbO54788 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffbO54788 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffbO54788 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffbO54788 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffbO54788 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffbO54788 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffbO54788 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffbO54788 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffbO54788 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffbO54788 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffbO54788 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffbO54788 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffbO54788 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffbO54788 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffbO54788 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DffbO54788 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DffbO54788 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffbO54788 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffbO54788 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffbO54788 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffbO54788 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffbO54788 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffbO54788 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffbO54788 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffbO54788 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffbO54788 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffbO54788 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffbO54788 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffbO54788 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffbO54788 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffbO54788 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffbO54788 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffbO54788 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffbO54788 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffbO54788 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffbO54788 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffbO54788 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms