Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr3O09116 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr3O09116 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr3O09116 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms