Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm8356J3QPD3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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