Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20825J3QM67 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm20825J3QM67 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm20825J3QM67 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20825J3QM67 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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