Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930544D05RikJ3QK56 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms