Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm17535J3KMR8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17535J3KMR8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17535J3KMR8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17535J3KMR8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17535J3KMR8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17535J3KMR8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm17535J3KMR8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm17535J3KMR8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm17535J3KMR8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms