Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gm20828J3KMI7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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