Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r167G3UW71 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r167G3UW71 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r167G3UW71 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms