Protein–RNA interactions for Protein: F7CNM6

1700056E22Rik, RIKEN cDNA 1700056E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700056E22RikF7CNM6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700056E22RikF7CNM6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700056E22RikF7CNM6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700056E22RikF7CNM6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1700056E22RikF7CNM6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700056E22RikF7CNM6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700056E22RikF7CNM6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700056E22RikF7CNM6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700056E22RikF7CNM6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700056E22RikF7CNM6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700056E22RikF7CNM6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms