Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8220F6YKI2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms