Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8444F6XS56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8444F6XS56 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms