Protein–RNA interactions for Protein: E9Q735

Ube4a, Ubiquitin conjugation factor E4 A, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube4aE9Q735 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube4aE9Q735 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube4aE9Q735 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube4aE9Q735 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms