Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20518E9Q548 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms