Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4930523C07RikE9Q2T4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
4930523C07RikE9Q2T4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930523C07RikE9Q2T4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930523C07RikE9Q2T4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms