Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930426L09RikE9Q0N7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930426L09RikE9Q0N7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930426L09RikE9Q0N7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms