Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc62E9PVD1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc62E9PVD1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms