Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc13D3YV10 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc13D3YV10 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms