Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbb-bh2B2RVB7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms